军事科学院是我军的最高科研殿堂，国防大学是我军的最高学府，在此轮军改前，二者都是与军兵种、大军区平级的正大军区级单位。
此轮军改中，非作战单位进行了大面积的裁、撤、并、减，军事科学院、国防大学也不例外，吸收合并了诸多机构，但是，规格一起降为了副战区级。
同时，二者的下属机构也进行了调整，目前，军事科学院的下属研究院、国防大学的二级学院都是相同的8个。
首先，介绍一下军事科学院。
1958年3月15日，军事科学院正式组建成立，由叶帅担任首任院长兼政委，副职中包括2位大将、8位上将，可见我军对科研工作的重视。
此后数十年间，军事科学院的科研范围也在逐渐增长：
1、组建初期，设“战争理论、战术、战史、外国军事”4个研究部；
2、上世纪70年代，调整为“战略、战役战术、军制、军事历史、军事百科、外国军事”6个研究部；
3、此轮军改前，则设置“战争理论和战略、作战理论和条令、军队建设、军事历史和百科、世界军事”5个研究部。
此轮军改中，军事科学院吸收合并了诸多的科研单位，与原先的科研部重组、调整为全新的8个研究院，分别是“战争、军队政治工作、军事法制、系统工程、国防科技创新、军事医学、防化、国防工程”研究院。
例如，军事医学研究院就是原先总后勤部下属的“解放军军事医学科学院”转隶、调整而来，是全军最高医学研究机构。
又比如，防化研究院是原总装备部下属的“解放军防化研究院”转隶、调整而来，是防化装备科研机构。
可以看到，军事科学院的科研范围大幅扩大，已经覆盖科技研究、装备研究、工程应用等综合性领域。
然后，介绍一下国防大学。
国防大学的组建时间明显晚于军事科学院，直到1985年12月24日才正式组建成立。
不过，其前身可追溯到1951年1月15日成立的解放军军事学院，1969年与“政治学院、高等军事学院、后勤学院”合并为“解放军军政大学”，1977年又分拆为“军事学院、政治学院、后勤学院”3所院校，直到1985年又三校合并为国防大学，成为了我军的最高学府。
组建初期，国防大学下设若干教学科研机构和学员管理机构：前者共有13个，分别是“战略、战役、军队指挥、军兵种、外军、马克思主义理论、党史党建政治工作、世界经济政治、后勤、外训、科技、外语、电化”教研室（中心）；后者共有6个，分别是“国防研究系、基本一系、基本二系、进修系、外训系、研究生院”。
2003年，13个教研机构重组为“战略、战役、马克思主义、信息作战与指挥训练、军队建设与军队政治工作、军事后勤与军事科技装备”6个教研部。
此后，学院管理机构也经历了多次重组，例如基本一系、基本二系合并为基本系，外训系调整为防务学院，最终确定为“国防安全、联合指挥与参谋、防务、进修、研究生”5个学院。
此轮军改中，国防大学吸收合并了“石家庄陆军指挥学院、后勤学院”等7所军事院校，与原先的教研部、学院管理机构重组为全新的8个二级学院，分别是“国家安全、联合作战、军事管理、政治学院、联合勤务、军事文化、国际防务、研究生”学院。
例如，军事文化学院就是原先总政下属的“解放军艺术学院”转隶、调整而来，是我军目前唯一的艺术院校。
又比如，联合作战学院就是原先总参下属的“石家庄陆军指挥学院”与原先国防大学下属的1个学院、2个教研部重组而来，是我军联合作战指挥和参谋人才培养的最高学府。
可以看到，国防大学的下属机构也进行了明显的精简。
值得注意的是，军事科学院、国防大学虽然降格为了副战区级，但存在主官高配的现象。例如，目前军事科学院的院长、政委以及国防大学的政委都由正战区职的上将出任。